EL CARMEN:Iglesia mandada a construir, junto con el Monasterio del Carmen, que ocupó una manzana, por la Marquesa de San Miguel de la Vega, hacia el año 1730. Donde está el Palacio de Santander, era solar de este Monasterio, que fue fundado en 1729. Obligadas sus monjas a abandonarlo en 1863, para tomarlo el gobierno nacional, éste lo cedió al Cauca en 1870, a fin de que lo aplicara a una escuela o colegio de niñas.
LA CATEDRAL: En el este sitio que actualmente ocupa , el sábado 13 de enero de 1537, fecha de fundación de la ciudad, se inauguró por orden de Belalcázar, una rústica capilla dedicada a Nuestra Señora del Reposo o del Tránsito. La primera misa solemne allí celebrada fue el 15 de agosto, y en ella se consagró la incipiente iglesia a nuestra señora de la asunción. Esta primera capilla fue sustituida en 1558, por la primera Iglesia Catedral, con techo de paja, por el obispo don Juan del Valle, y situada donde hoy se halla la ermita.
LA ENCARNACION: Primoroso templo construido de 1764 a 1767, aunque no completamente terminado entonces, por el hermano Simón de la Compañía de Jesús, a quien confió la obra la Reverenda Madre Mariana de San Estanislao, eximia religiosa que nació en Cali en 1726, entró al convento en 1742 y fue priora desde, 1764 hasta 1782, año en el cual ya había dado al servicio esta iglesia. Se edificó en el mismo sitio donde estuvo la primera, que las religiosas habían levantado y que destruyó el terremoto de 2 febrero de 1736. La Madre Mariana murió en 1795.
LA ERMITA: Esta venerable iglesia, es la más antigua de las que hay en la ciudad. Fue construida en virtud de una disposición testamentaria de Dn. Pedro de Velasco y Zúñiga en el año de 1617, en el mismo lugar donde había existido una rústica de paja dedicada a Santa Catalina y Santa Bárbara, de cuya Cofradía era síndico Dn. Pedro, que debió de ser fabricada por los conquistadores en aquellos días en que se edificó, en el lado sur de la plaza principal, el primer templo que hubo aquí: donde se alza la catedral. Por ser de reducidas proporciones pudo resistir los terremotos ocurridos entre 1736 y 1906.
SAN AGUSTIN: Esta Iglesia perteneció a los padres Agustinos que fundaron aquí su convento a fines del segundo tercio del siglo XVI. Fue dispuesta en construcción por el Ilmo. Sr. Fray Agustín de La Coruña, de la orden de los ermitaños Agustinos, en 1578. Esta primera iglesia se cayó, como las demás, con el terremoto de 1736. Se reedificó con un legado de Dn.Jacinto de Mosquera Figueroa y Silva, con diez mil pesos que al efecto dio la Marquesa de San Miguel de la Vega y otro importante donativo del Prbo.Dn. José Beltrán de Caicedo.
SAN FRANCISCO: "Es el testimonio barroco más valioso de lo que fue el territorio de la actual República de Colombia."
Respecto a las fechas de construcción e inauguración existen diferentes datos presentados por los historiadores de esta ciudad. Es así como en el libro "Muros de Bronce" del Doctor Diego Castrillón Arboleda se lee: "Es un proyecto del Arquitecto español Antonio García, construido entre 1715 y 1818.."; el Doctor Jaime Vejarano Varona en su libro "Popayán Relicario de Colombia" manifiesta: "Los arquitectos españoles dieron comienzo a su construcción en julio de 1775, junto a la vieja casona conventual fundada por el padre Fray Jodocco Riquer, fundador de las órdenes franciscanas de América, entre 1568 y 1570. Su construcción duró 20 años."; en su libro "Guía de la Ciudad de Popayán (Histórico - Turística)" del Doctor José María Arboleda Llorente se lee que "En 1795 se inauguró este suntuoso templo."
Respecto a las fechas de construcción e inauguración existen diferentes datos presentados por los historiadores de esta ciudad. Es así como en el libro "Muros de Bronce" del Doctor Diego Castrillón Arboleda se lee: "Es un proyecto del Arquitecto español Antonio García, construido entre 1715 y 1818.."; el Doctor Jaime Vejarano Varona en su libro "Popayán Relicario de Colombia" manifiesta: "Los arquitectos españoles dieron comienzo a su construcción en julio de 1775, junto a la vieja casona conventual fundada por el padre Fray Jodocco Riquer, fundador de las órdenes franciscanas de América, entre 1568 y 1570. Su construcción duró 20 años."; en su libro "Guía de la Ciudad de Popayán (Histórico - Turística)" del Doctor José María Arboleda Llorente se lee que "En 1795 se inauguró este suntuoso templo."
SAN JOSE : Antes de ser fundado el Seminario por la Compañía de Jesús, en el año de 1642, los sacerdotes Vicente Imperial y Gabriel Arcola levantaron un humilde templo en el sitio actual. En 1702 se encargó al hermano Simón Schenherr preparar unos planos para hacer un templo, conforme a los lineamientos barrocos acostumbrados por la Compañía para sus construcciones en Latinoamérica. Con recursos propios y de la Marquesa de San Miguel de la Vega dieron comienzo al templo actual, por lo que lleva el nombre de la compañía.
SANTO DOMINGO:La primera iglesia de Santo Domingo, fundada en 1588, subsistió hasta el terremoto del 2 de febrero de 1736 que la destruyó totalmente. La reedificación fue concluida en 1741. La levantaron miembros de la familia Arboleda y el Deán Dn. Mateo de Castrillón Bernaldo de Quirós, que costeó la nave de la epístola. Aquellos eran descendientes directos de Francisco de Arboleda Salazar, quien con su hermano el Pbro. Dn.Pedro, habían construido la primera. La actual ostenta un hermoso portalón en piedra, de estilo rococó, que junto con su pila fueron tallados antes de 1754.